Porém a exportação será feita em nome da empresa compradora, minha duvida é, o CFOP 5501 e 6501 acoberta a saída da mercadoria, gera financeiro e tributação?

A descrição dos cfop indicam que que a operação é de remessa

5.501 - Remessa de produção do estabelecimento, com fim específico de exportação.
Classificam-se neste código as saídas de produtos industrializados ou produzidos pelo próprio estabelecimento, remetidos com fim específico de exportação a trading company, empresa comercial exportadora ou outro estabelecimento do remetente.

6.501 - Remessa de produção do estabelecimento, com fim específico de exportação.
Classificam-se neste código as saídas de produtos industrializados ou produzido pelo próprio estabelecimento, remetidos com fim específico de exportação a trading company, empresa comercial exportadora ou outro estabelecimento do remetente.

E nas exportações não se aplica o Diferimento.

E para o produtor exportar ou fazer remessa para exportação ele deve estar credenciado para isso.

E a venda será usado o CFOP

7.501 - Exportação de mercadorias recebidas com fim específico de exportação.
Classificam-se neste código as exportações das mercadorias recebidas anteriormente com finalidade específica de exportação, cujas entradas tenham sido classificadas nos códigos "1.501 - Entrada de mercadoria recebida com fim específico de exportação" ou "2.501 - Entrada de mercadoria recebida com fim específico de exportação".

Gostaria de Saber se o CFOP 5501 e 6501 acobertam venda de MILHO produzido no estabelecimento ou se são somente remessa sendo necessário posteriormente emitir uma nota de venda.

Caso seja um CFOP que acoberta uma venda gostaria de saber se produtor mt credenciado poderá emitir a nota nesses CFOP com o ICMS diferido.